作物学报 第34卷 构建消减cDNA文库,以接种病菌为测试方(tester), 对照为驱动方(driver),消减产物克隆于pGEM—T并 转化Escherichia coli DH5a(Invitrogen)。利用PCR— Select Differential Screening kit(Clontech)筛选出384 cDNA阳性克隆。由上海生工生物技术公司测定序 列,利用GenBank的Blast程序比对核酸数据,以 Clustal W线性比对氨基酸序列,用MEGA软件l ] 绘制系统进化树。 1.5分离全长nsLTP cDNA 因获得的相关EST含有3 UTR,故利用5 一RA CE法分离其全长,采用SMART—RACE cDNA Ampl—iifcation Kit(Clontech),设计5 基因特异引物 GSP1:5 一CCACAACACCCTCCAATAGGACCGC一3 和GSP2:5 GGGAGGCAGGGAGCCAAGCCAGA TGTAA一3 配合通用引物UPM克隆全长,命名为 StLTPal,GenBank登录号EU057716。 1.6 Rea1.time PCR、RT.PCR和Northern杂交 参照Jain等l 1方法进行Real—time PCR,利用 Bio—Rad iCycler iQ检测系统进行反应并分析。根据 Wawrzynska等 方法进行Northern杂交和RT— PCR。Real—time PCR正向引物为5 一TGGCTCCCTG CCTCCCTI'ATC 3 ,反向引物5 一CCATC1] rrCTT CATCTCCG..3,内参Actin(GenBank登录号X55747) 引物分另U为5 一GCTTCCCGATGGTCAAGTCA一3 ,5 一 GGATTccAGcTGcTTccATTc.3 。根据Pfafif等l ] 方法进行反应特异性和相对表达量计算。RT—PCR 引物为5 一GCTCCCTGCCTCCC丌ATCTT-3 ,5 一CTT TTCCCGTATCAATGCCCT-3 。实验重复3次。 1.7 组织原位杂交 根据Elorza等l 利用地高辛标记的RNA探针 与马铃薯茎叶石蜡组织切片进行原位杂交。StLTPal 基因特异PCR产物用于合成探针,正义和反义探针 利用DIG RNA Labeling kit(SP6/T7;Roche)标记地高 辛一UTP,引物分别为5 一cATcTTATTcTTcATcTc CGC一3 和5 一GGCTCCCTGCCTCCCTTATC一3 2结果与分析 2.1克隆和鉴定StLTPal基因 通过构建病原诱导马铃薯茎特异的消减cDNA 文库,利用5 一RACE PCR从获得的相关克隆中扩增 出编码nsLTP的全长cDNA,长636 bp,命名为 StLTPal,GenBank登录号EU057716。序列分析发现 其结构与其他物种如拟南芥、水稻等I类非特异性 脂质转移蛋白类似,等电点较接近,约为9.40。经推 导,该基因编码1l4个氨基酸,同时具有保守的信 号肽序列和半胱氨酸[26-27],切除信号肽后的成熟蛋 白质具91个氨基酸(图1)。经Clastal W比对,发现 该基因与其他茄科nsLTP具有高度保守的序列特征, 核酸和氨基酸水平分别具75%~85%和60%~92%的 同源性。 TATCATCCTCTACTATTTCTATCGATCTTTACTCAATTTTTGTAACAATGGAAATGTTTG 60 M E M F -20 GCAAAATTGcATGCTTCGTGCTTTTGTGCATGGTGGTGGTTGCACCCcGTGCAGAGGCAC 1 2O G 工 冉 C F V 工 工 C M V V V A P R A E A l TGAGCTGCGGCGAGGTTACATCTGGCTTGGCTCCCTGCCTCCCTTATCTTCAAGGGCGcG l 8O L S C G E V T S G L A P C L P Y L Q G R 2I GTCCTATTGGAGGGTGTTGTGGTGGTGTTAAGGGTcTGTTGGGTGCAGCCAAGACCCCAG 240 G P I G G C C G G V K G L L G A A K T P 4l AAGACCGGAAGACAGCATGCACTTGCCTGAAATCGGCAGCTAATTCTATTAAGGGCATTG 300 E D R K T A C T C L K S A A N S I K G I 6l ATACGGGAAAAGCCGTTGGTCTCCCTGGAGTTTGTGGAGTCAGCATTCCTTACAAGATCA 360 D T G K A V G L P G V C G V S I P Y K I 8l GCCCTTCCACTGATTGCTCCAAGGTcCAGTAAGGTTGATGAAATTAAAGCTAAGTCTATA 420 S P S T D C S K V Q 9l TATAGCTTGCGGAGATGAAGAATAAGATGGATATATATCGATCGAGTTTGATcCATCATT 480 ATAT^TGTTGTCTCTTTTCTTTTGTATTTGTGTTTGTTGG^GTACTTATATATTGTCGAG 540 TCTTGTAATGAACATTAGTGGTTGCTTGTGTTACAACTCAATCTTCATATAGTAATACAT 600 GATATTGTACTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 636 图1 StLTPal的核苷酸序列以及推导的氨基酸序列 Fig.1 Composite nucleotide sequences of the cDNA for StLTPal and the deduced amino acid sequence 氨基酸序号自成熟蛋白质N端的丙氨酸编起;斜体部分为信号 肽;两线部分为钙调素结合位点。 The amino acids are numbered from the alanine residue found at the amino terminus of the mature protein;the regions of signal peptide are italic;the region of CaM.binding site is underlined. 采用邻接法构建了茄科48个nsLTP的无根系统 发生树(图2),从系统发生树上节点位置和分支长度 的量化数值上分析,尽管存在小的不同的亚类,但 大的分类上可以将茄科现有的nsLTP分为I、II、III 类,这3类大致符合nsLTP1、2、3的分子特 。其 中I类群包纳的nsLTP最多,涉圾的种较多,几乎都 是nsLTP1;II类群最少,全是烟草(Nicotiana glauca) nsLTP1:第1II类群主要包括了nsLTP2类转脂蛋白, 与其他nsLTP1明显具有较长的系统发生距离。从图 中可以看出马铃薯StLTPal基因与番茄( .1ycoper. sicum)的一个nsLTP1同属一支,显示它们可能具有 共同的起源。唯一有出入的马铃薯BAC23052 nsLTP 因其本身序列明显短于其他成员而归属于第1II类, 怀疑是分歧所致的。另外StLTPa1基因编码的产物 虽然与马铃薯其他成员同归于I类,但分属于两个 不同的亚群,这暗示在马铃薯基因组中存在其他新 成员的可能性。 维普资讯 http://www.cqvip.com 第9期 郜 刚等:马铃薯非特异性脂质转移蛋白基因StLTPal的克隆和表达 图2基于成熟氨基酸序列的茄科nsLTP的系统发生树 Fig.2 Phylogenetic relationships of the Solanaceae nsLTPs based on sequence alignments of the mature encoded proteins 以48个单一氨基酸序列作分析;各蛋白的原始序列接受号列于种名之后;底部标尺表每个位点发生0.1次氨基酸替代的进化距离; 系统发生树使用MEGA软件采取邻接法构建。 The analysis was based on alignment of 48 unique amino acid sequences.The primary accession numbers for the protein sequences used to compile the tree are followed the speciifc name.The scale bar corresponds to an evolutionary distance of 0.1 amino acid(aa)substitution per site.The evolutionary tree was constructed by the Neighbor—Joining method and drawn by山e MEGA program. 2.2青枯菌诱导StLTPal基因在不同抗、感病基 因型中的表达模式 为探讨StLTPal基因在马铃薯与青枯菌互作早 特征进行了系统分析(图4),StLTPal基因不仅在抗、 感病基因型中具有病菌诱导表达的差异性(图4一A对 B、C对D),而且在同一类型马铃薯的不同部位也存 在较明显的差异(图4一A对C、B对D),表现出一定 期表达的时间和空间特性,采用两步分析法对接种 后的马铃薯茎叶组织RNA转录本丰度随着早期病 程发展的变化进行了比较。首先,对接种后总RNA 的系统诱导性。病菌在抗病基因型中能够诱导 StLTPal基因既快速且持久地表达,相对靠近接种 在不同时问点进行Northern blot分析(图3),结果显 示接种后3~5 d StLTPal转录本在抗病基因型和感 点的下部茎叶组织表达量较弱,远离接种点的上部 茎叶组织中表达量较强;而在感病基因型中这种诱 病基因型中都表现上调,抗病基因型中诱导的速率 和强度较高于感病基因型,表明该基因不仅受病原 的诱导,而且受寄主故有抗性的影响。第二步用 Real—time PCR对该基因在不同组织位置之间的表达 导是短暂的,在接种后3 d时达到最高峰,随后有所 减弱,与抗病基因型另一个不同点在于下部茎叶组 织的诱导强于上部组织,似乎反映出病菌在感病基 因型中能够较快克服该基因产物的作用。这一点与 维普资讯 http://www.cqvip.com
S a 作物学报 第34卷 儿 T m n 病原菌在寄主体内的居群动态相吻合(图3-E、F)。 兰! ! Resistant 0 dpi 1 dpi 3 dpi 5 dpi 0 dpi 1 dpi 3 dpi 5 dpi 图3 StLTPal基因表达的Northern分析 Fig.3 Northern analysis of StLTPal gene expression 2.3 StLTPal基因表达受非生物激发子的影响 如图5所示,水杨酸、茉莉酸和脱落酸都能够 不同程度地诱导StLTPal基因上调表达,从处理后1 d起,至3 d或5 d达到高峰,这种上调持续的时间 较长,尤其是在抗病基因型中。在感病基因中,茉莉 酸和水杨酸诱导的StLTPal转录本在表达高峰后都 一定程度地下降,相对于脱落酸的作用而言,相对 表达量较弱。在抗病基因型中,这种效果尤其明显, 这表明脱落酸可能对StLTPal的诱导存在不同于水 杨酸或者茉莉酸的机制,这种机制使StLTPal基因 的上调表达更快捷,以至于使其转录本在接种后1 d 的丰度就高于其他两种激发子的作用。显示脱落酸 对该基因的调控更加有效。 2.4 StLTPal基因表达的组织定位 利用原位杂交对StLTPal基因表达进行组织定位 结果(图6)显示,在接种后3 d取材的杂交中,StLTPal mRNA主要分布在茎微管系统的韧皮部和叶片维管 束,在茎的表皮细胞有极微弱的杂交信号。作为对 照的未接种健康植株未见杂交信号。对根组织的原 位杂交中,无论接种与否均未检测到有该基因的表 达。说明病菌诱导的StLTPal基因表达位点主要在 茎叶组织的韧皮部而非木质部。 3 讨论 3.1 StLTPal基因结构与进化 本研究从马铃薯中克隆了一个新的nsLTP1基 因,对其结构特征、表达性质和组织定位等的分析 为此类蛋白生物学功能的确定提供线索。StLTPal 具有I类nsLTP所共有的结构特征如低分子量、保 守的半胱氨酸残基、碱性等电点、以及位于C一末端 的钙调素结合位点【1引,而且序列整体具高度相似性; StLTPa1在系统进化树上与Jung等 , 。 报道的受病 菌诱导的辣椒nsLTP同处一个亚群,暗示其可能参 与青枯病防御反应,这一点在病菌诱导表达分析中 得到了证实。这与以往发现的其他植物脂质转移蛋 白参与抗病反应的结果是一致的[27,29-351。对StLTPal 基因编码的氨基酸序列进行保守区及功能位点和系 统发生分析表明它是马铃薯非特异性脂质转移蛋白 家族的一个新成员,在进化上与番茄(S.1ycopersi。 cum)的nsLTP(P93224)具共同的祖先。 3.2青枯菌诱导StLTPal基因在不同抗、感病基 因型中的表达模式 非特异性脂质转移蛋白参与植物防御反应的分 子机制目前并不清楚,研究者一般通过分离纯化蛋 白质、体外检测其活性llⅢ,或者在植物体内分析其 对病原物反应的基因表达模式来确定其活性[28,30]。 某些nsLTP1被认为是与角质素和木栓层的形成相 关联的,可以抑制真菌等的生长。从辣椒(Capsicum anuum)中分离的一个LTP在拟南芥中的异源表达能 够增加其对灰霉病抗性ll 。本研究关于StLTPal在 不同抗病材料中存在差异表达的实验结果说明 StLTPal的表达参与了寄主植物的抗性反应,在病 理学上表现为可以在一定程度上抑制青枯菌在马铃 薯体内的居群扩张,与病菌在微管系统的居群动态 有一定的关联。在以往的实验结果中尚未见类似报 道。 马铃薯青枯病属于维管束系统病害ll引,维管束 系统由韧皮部和木质部构成,在植物体内形成连续 的运输系统,负责运输水分、营养和信号分子。在 马铃薯青枯病中,这种特殊的结构系统却成了病原 菌入侵、定殖和扩张的场所。StLPTal基因在微管 系统的诱导性表达模式提供了这样一种可能性,即 其表达可能诱导了某种特殊信号,进而导致对病菌 入侵和扩张的连续反应。虽然目前尚未确定这种诱 导信号分子,但是StLPTal在下部感染位点(1ower infection site)和上部系统位点(upper systemic site)的 差异表达暗示存在某种可以长距离传输的信号。 Maldonado等[161发现在拟南芥脂质转移蛋白DIR1 在病菌入侵的情况下可以与一种脂源分子(1ipid— derived molecule)互作并促进长距离信号传导。这种 脂源分子可能是由病菌的质膜上合成或者释放的羟 脂如茉莉酸、磷脂酸或者N一酰基乙醇胺,在植物防 御信号中能够起到次级信使的作用。植物非特异性 脂质转移蛋白的空间结构表明其内部的疏水性腔足 以容纳脂肪酸或者磷脂分子,而其氨基端的信号 维普资讯 http://www.cqvip.com 第9期 郜 刚等:马铃薯非特异性脂质转移蛋白基因StLTPal的克隆和表达 1515 A B uN c0I】曼:口0口高IJu 0对 >u—c0 ∞ 口 u u^l >u—c0 ∞ u u三 一u Days post inoculation C u c0一 j 0口 £ul。对∞ >u—c0 ∞ 口 u u^I D >u—c0 ∞ 口×u u之 F 6 一u暑∞ 基u1s 0 f1 u 0一一 5 4 3 2 1 0 Days post inocul ̄ion E 6 Days post inoculation 5 —兰 4 g 0 ∞ 0 J r= O 3 Days post inoculation Days post inoculation 5 图4 马铃薯与青枯菌互作早期,StLTPal基因在不同抗感病基因型中的差异表达 Fig.4 Diferential expression of StLTPal gene in diferent potato genotypes during the early stage ofR.solanacearum-potato interactions A和B:不同时间点StLTPal基因在感病(A)、抗病(B)基因型上部茎叶组织(6~7节)之间的差异表达的real—time PCR检测,Actin为内 参,将其丰度平均值设为1,相对表达丰度均与内参比较使其标准化,统计学显著性为3次重复的f一检验,P<0.Ol,误差线表示平均值±标 准误;C和D:不同时间点StLTPal基因在感病(c)、抗病(D)基因型下部茎叶组织(第2~4节)之间的差异表达;E和F:青枯菌(生理小 种3号,生化变种2号,菌株PO41)在感病(E)、抗病(F)基因型茎维管组织中的居群动态。重复3次,每次3株。 A and B:Time courses of 见 口』gene expression in the upper(between 6th一7th nodes)tissues of susceptible(A)and resistant(B)geno— types at various time intervals after inoculation by real—time PCR.The values were normalized to actin at each time—point.Statistical signifi— cance for the observed up—regulation was calculated wih Studentts t-test:P<0.O1.Error bars represent the mean±standard error.As a contro1. healthy plants were mock—inoculated with water.C and D:Relative transcript levels of StLTPa1 gene in the lower fbetween 2nd一4th nodes) tissues of susceptible(C)and resistant(D)genotypes at various time intervals after inoculation.E and F:Population sizes of strain PO41 in potato of susceptible(E)and resistant(F)genotypes at different stages of infection.Overground stem tissues were sampled by grinding and effluent water was dilution—plated directly.Wih Sttudent’S t-test,triplicate experiments were tested at P<0.05 and 3 plants tested for each. 肽可以将成熟蛋白定位至细胞壁¨引,因此这些特性 为nsLTP发挥这种参与长距离信号传导的功能提供 3.3 StLTPal基因的表达受非生物因子的影响 最近一些报道显示植物的nsLTP表达通常与防 了可能性。本研究中StLPTal的茎叶组织特异性和 系统诱导表达似乎也支持了这一点。综上所述, StLTPal基因的组织原位杂交和时空表达模式显示 御信号分子相关联[1,12-131。VvLTP4与茉莉酸形成的 复合体在体外试验中能够诱导葡萄(Vitis vinifera)对 灰霉病(Botrytis cinerea)的高水平耐性…。烟草 了该基因在维管束系统中发挥其生物学功能。 NtLTP1可以结合茉莉酸形成复合体并与一种质膜 维普资讯 http://www.cqvip.com
l5l6 作物学报 第34卷 Susceptible ABA SA MJ Mock Actin 图5 化学处理后StLTPal基因在马铃薯茎中的 表达的RT-PCR检测 Fig.5 Relative expression of the StL j in potato stems at variOUS time intervals after treatment with plant hormones Mock:模拟处理作为对照;Resistant:抗病基因型;Susceptible: 感病基因型:图示为一次代表性试验结果,使用的激素为ABA (50 ̄tmo!L )、SA(5 mmo|L )、MJ(50 ̄tmol L )。 Mock:Healthy plants were mock—treated as control:resistant:re— sistant genotypes;susceptible:susceptible genotypes.The results in figure 4 are from a representative corresponding experiment with SA(5 mmol L ),MJ(50 umol L叫),and ABA(50 mol L_。). 图6 StLTPa1基因在马铃薯茎叶组织表达的原位杂交 Fig.6 In situ localization of StLTPal mRNAs in potato stem and leaf tissues A:叶组织横向切片用于正义StLTPal RNA探针的杂交;B:茎 组织横向切片用于正义StLTPal RNA探针的杂交;C:叶组织横 向切片用于反义StLTPal RNA探针的杂交;D:茎组织横向切片 用于反义StLTPa1 RNA探针的杂交。箭头所示为杂交信号。UE: 上表皮:LE:下表皮;op:外韧皮部;ip:内韧皮部;Vs:维管束; x:木质部。标尺长度10 LLm。 A:Consecutive 10 p.m transverse sections of the leaves were hybridized with the sense StLTPal RNA probes.B:Consecutive 10 um transverse sections of the stems were hybridized with the sense StLTPal RNA probes.C:The antisense StLTPal RNA probes were hybridized with the consecutive 10 p.m transverse sections of leaves.D:The antisense StLTPal RNA probes were hybridized with the consecutive 10 Um transverse sections of stems.The arrowheads point out hybridization signa1.UE:upper epidermis;LE:lower epidermis;op:outer phloem;ip: inner phloem;Vs:vascular bundle;x:xylem.Bars=l0 um. 定位的受体分子(elicitin receptor)发生作用 。在其 他植物中,nsLTP的表达还受乙烯、水杨酸、脱落酸 等非生物激发子的诱导 11,29]。本文StLPTal的表达 受到水杨酸、茉莉酸和脱落酸的影响,说明在与病 菌互作过程中StLPTal的表达处于一种较复杂的调 控网络中。有必要针对该基因表达的精细细胞定位 和信号调控做进一步的深入研究,这对于解释早期 马铃薯与青枯菌的互作机理乃至为今后青枯病的控 制提供新的目标具有理论意义。 4 结论 从马铃薯cDNA文库中克隆了非特异性脂质转 移蛋白基因StLPTa1,开放阅读框为636 bp,编码91 个氨基酸残基的成熟蛋白,在结构上具有nsLTP1的 共同特征,进化地位与其他茄科nsLTP1高度类似; StLPTal在马铃薯与青枯菌互作的早期受病菌的诱 导而上调表达,在不同抗、感病材料中有明显差异, 相对感病基因型而言,在抗病基因型中的诱导表达 更快、更高、更强;StLPTal基因表达具组织特异性, 主要位于茎叶组织维管系统的韧皮部,未见于根; 同一基因型的马铃薯上部组织和下部组织中的表达 略有差异;StLPTal基因表达受水杨酸、茉莉酸和脱 落酸的诱导。 致谢:本论文部分工作得到山西师范大学生命科学 学院2004级硕士研究生张丽萍的帮助,在此表示感 谢。 References [1]Yeats T H,Rose J K C.The biochemistry and biology of ex— tracellular plant lipid—transfer proteins(LTPs).Protein Sci,2008, l7:l9l—l98 [2]Jose—Estanyol M,Gomis—Ruth F X,Puigdomenech P.The eightcysteine motif,a versatile structure in plnat proteins.Plant Physiol Biochem,2004,42:355—365 [3]Kader J C,Julienne M,Vergnolle C.Puriifcation and characteri— zation of a spinach—leaf protein capable of transferring phosphol— ipids from liposomes to mitochondria or chloroplasts.Eur J Bio— chern.1984.139:41 l l6 [4]Boutrot E Chantret N,Gautier M F Genome—wide analysis of the irce and arabidopsis non—specific lipid transfer protein(nsLtp) gene families and identification of wheat nsLtp genes by EST data mining.BMC Genomics,2008,9:86 [5]Kader J C.Lipid—rtnasfer proteins:A puzzling family of plant proteins.Trends Plant Sci.1997.2:66—70 [6】Lauga B,Harbonnel—Campaa L,Combes D.Characterization of MZm3・i a Zea mays tapetum—speciifc transcript.Plant Sci,2000, l57:65—75 [7】Chae K,Zhang K,Zhang L,Morikis D,Kim S T,Mollet J C,de la Rosa N,Tan K,Lord E M.Two SCA(stigma/style cys— 维普资讯 http://www.cqvip.com 第9期 郜 刚等:马铃薯非特异性脂质转移蛋白基因StLTPal的克隆和表达 1517 teine—rich adhesin)isoforlrlS show structural differences that cor- relate with their levels of in vitro pollen tube adhesion activity.J Biol Chem,2007,282:33845—33858 [8]Salcedo G,S ̄nchez—Monge R,Barber D,Diaz・Perales A.Plant non—specific lipid transfer proteins:An interface between plant defence and human allergy.Biochim Biophys Acta,2007,177 l: 78l—79l [9]Samuel D,Liu Y J,Cheng C,Lyu P C.Solution structure of plnat nonspeciifc lipid transfer protein一2 from rice fOryza sativa).J Biol Chem,2002,277:35267—35273 [10]Carvalho A O,Gomes V M.Role of plant lipid transfer proteins in plant cell physiology--A concise review.Peptides,2007,28: l 144-ll53 [11]Blein J P,Coutos—Thevenot P,Marion D,Ponchet M.From elic. itins to lipid・-rtansfer proteins:A new insight in cell signaling in・- volved in plant defence mechanisms.Trends Plant Sci,2002,7: 293-296 [12]Jung H W,Lim C W,Hwang B K.Isolation and functional analysis of a pepper lipid transfer protein III tCALTPIIl1 gene promoter during signaling to pathogen,abiotic and environmental rtesses.Plant Scf,2006,170:258 ̄56 [13]Jung H W,Kim K D,Hwang B K.Identification ofpathogen re— sponsive regions in the promoter of a pepper lipid rtansfer protein gene(CAL ,)and the enhanced resistance of the CALTPI rtansgenic Arabidopsis against pathogen and environmental stresses.Planta,2005,22 l:36 1.73 [14]Lu Z X,Gaudet D,Puchalski B,Despins Frick M,Laroche A. 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