曹州牡丹园主要以牡丹为主题的旅游景点，这里的游览面积比较大，景区共有1060000平方米，那么在曹州牡丹园内的主要游览景点有哪些地方呢？
曹州牡丹园位于市区人民路北端，面积达1600亩。园内主要设有城市北入口景区，东西大门入口景区、牡丹古韵游览区、湖山景观游览区、四季牡丹观赏区、牡丹繁殖基因库、牡丹文化旅游区、天香阁游览区、儿童休闲娱乐区等，有观花楼、牡丹传奇、十二花神、芍药台、世界国花园、国花馆等景点，拥有牡丹九大色系十种花型共1165种，其中具有百年以上树龄的古牡丹一百余株。园内还穿插有芍药品种600多个，其他乔、灌木、地被植物共计200余种。
湖山景观游览区
湖山景区是全园的核心景区之一，在山水之间、林木之间不经意便会发现自然栽植的牡丹，或生于岩石之中，或洒于山坡之上，尽显牡丹自然之美。岩石园是湖山景区中的高潮部分，它是在原有山体的基础上规划的，采用台地叠石处理，牡丹与其他花灌木组景生长于石缝之中，层阶跌落的台地为各种花卉提供了良好的生长空间，与“迸珠溅玉”的叠瀑共同构建了层次丰富的立面景观效果。
四季牡丹观赏区
四季展览温室建筑面积约2000平方米，建筑外形像一个飘逸的飘带，里面设计成多个小花园，展示从冷库中冷藏的品种催花牡丹，供游客四季观赏。
牡丹繁殖基因库
曹州牡丹园是中国最大的牡丹科研中心，拥有科研成果近百项；曾代表国家参加法国波尔多国际花卉博览会和“99世界园世博览会”，并获大奖，被国家指定为“国家级牡丹、芍药标准化示范园区”、“863”计划——菏泽科研育种基地。
牡丹文化旅游区
牡丹的主体观赏区有九大色系圃、十大花型圃，牡丹品种1237个，牡丹总量达到80万株。
天香阁
天香阁是一座祭花神的仿古式建筑，是公园的制高点，登临其上，可以总览全园。内有卧佛殿，殿内供奉的玉卧佛是我省最大的玉佛，长5.4米，重25吨，系整块缅甸玉雕琢而成，由傅作义将军之女傅凤英女士无偿捐赠。