劳动者可直接向法院申请支付令以解决拖欠劳动报酬的问题，而不能直接起诉公司三个月不发工资。根据劳动法和劳动合同法的规定，劳动纠纷需先进行仲裁程序，对仲裁结果不满意可向法院提起诉讼。但对于拖欠劳动报酬的案件，劳动者可直接向法院申请支付令，法院应依法发出支付令。
法律分析
公司三个月不发工资不能直接起诉。但是对于拖欠劳动报酬的案件,劳动者可以直接向法院申请支付令。
根据《劳动法》79条的规定，法律规定劳动纠纷适用仲裁前置程序。当事人需要先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁不服的，可以向人民法院提起诉讼。
《劳动合同法》第30条规定：用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的,劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令,人民法院应当依法发出支付令。
拓展延伸
解决工资拖欠问题的法律途径及程序
解决工资拖欠问题的法律途径及程序主要包括以下几个步骤。首先，受害者可以与雇主进行沟通和协商，尝试解决问题。如果无法达成一致，可以考虑寻求劳动仲裁或劳动争议调解机构的帮助，提交申诉并提供相关证据。仲裁或调解机构将进行调查，并作出裁决或调解意见。如果雇主不履行裁决或调解意见，受害者可以向劳动监察部门投诉，并提供相关证据。劳动监察部门将进行调查，并可以对雇主进行处罚。如果以上途径仍无法解决问题，受害者可以考虑向法院提起诉讼，通过法律手段来维护自己的权益。在诉讼过程中，受害者需要准备充分的证据，并寻求法律专业人士的帮助。通过以上途径和程序，受害者可以寻求合法权益的保护和维护。
结语
劳动者在公司三个月不发工资的情况下，不能直接起诉。然而，对于拖欠劳动报酬的案件，劳动者可以直接向法院申请支付令。根据劳动法规定的仲裁前置程序，当事人需先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，如对仲裁结果不满意，可向人民法院提起诉讼。根据劳动合同法第30条规定，劳动者可依法向当地人民法院申请支付令，法院将依法发出支付令。解决工资拖欠问题的法律途径及程序包括与雇主沟通协商、劳动仲裁或调解、劳动监察部门投诉以及向法院提起诉讼等步骤。通过这些途径和程序，劳动者可以维护自身合法权益。
法律依据
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第二章 劳动合同的订立 第二十二条 【服务期】用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。
劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
用人单位与劳动者约定服务期的，不影响按照正常的工资调整机制提高劳动者在服务期期间的劳动报酬。
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第二章 劳动合同的订立 第二十五条 【违约金】除本法第二十二条和第二十三条规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第七章 法律责任 第八十五条 【未依法支付劳动报酬、经济补偿等的法律责任】用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：
（一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；
（二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
（三）安排加班不支付加班费的；
（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。