临床上诊断慢性前列腺炎须详细询问病史、全面体格检查（包括直肠指检）、尿液和前列腺按摩液常规检查。推荐应用NIH慢性前列腺炎症状指数进行症状评分。推荐“两杯法”或“四杯法”进行病原体定位试验。
为明确诊断及鉴别诊断，可选择的检查有：精液分析或细菌培养、前列腺特异性抗原、尿细胞学、经腹或经直肠B超（包括残余尿测定）、尿流率、尿动力学、CT、MRI、尿道膀胱镜检查和前列腺穿刺活检等。
具体诊断方法：
1.病史采集。
2.体格检查
直肠指检可了解前列腺大小、质地、有无结节、有无压痛及其范围与程度，盆底肌肉的紧张度、盆壁有无压痛，按摩前列腺获得前列腺液。
3.实验室检查
（1）前列腺按摩液（EPS）常规检查 正常的EPS中白细胞HP，卵磷脂小体均匀分布于整个视野，pH6.3～6.5，红细胞和上皮细胞不存在或偶见。当白细胞>10个/HP，卵磷脂小体数量减少，有诊断意义。
（2）尿常规分析及尿沉渣检查 尿常规分析及尿沉渣检查是排除尿路感染、诊断前列腺炎的辅助方法。
（3）细菌学检查 慢性前列腺炎推荐“两杯法”或“四杯法”病原体定位试验。
（4）其他病原体检查 包括沙眼衣原体和支原体检查。
4.器械检查
（1）B超检查 尽管前列腺炎患者B超检查可以发现前列腺回声不均，前列腺结石或钙化，前列腺周围静脉丛扩张等表现，但目前仍然缺乏B超诊断前列腺炎的特异性表现，也无法利用B超对前列腺炎进行分型。
（2）尿动力学 ①尿流率，尿流率检查可以大致了解患者排尿状况，有助于前列腺炎与排尿障碍相关疾病进行鉴别；②尿动力学检查，可以发现膀胱尿道功能障碍。
（3）CT和MRI 对鉴别精囊、射精管等盆腔器官病变有潜在应用价值，但对于前列腺炎本身的诊断价值仍不清楚。
治愈标准
1．自觉症状消失。
2．触诊时前列腺正常或改善。
3．定位分段尿试验正常。
4．前列腺液检查正常，细菌培养阴性，卵磷脂小体较治疗前明显增多(2次以上客观检查均阴性就更能证明其治疗效果的可信性)。
当然以上4点为临床痊愈标准，也可根据各标准对照定出改善或减轻之程度，以判断治疗效果。