大部分右肾结石患者，常常会出现腰痛或者肾绞痛，发作一般比较突然，而且还不断加剧，如刀割样剧烈的疼痛，常使肾结石患者面色苍白、大汗淋漓。病人还常伴有血压下降、恶心、呕吐等症状，疼痛一般局限于肾区。
局部损伤若小结石活动度大，局部损伤较轻。大而固定的结石，可导致肾盏、肾盂上皮细胞出现脱落，出现溃疡还可出现纤维组织增生。
肾积水右肾结石患者肾积水的主要原因是因为结石堵塞了肾盂、输尿管，使尿液的排出受到损害而造成的。长时间的肾积水，会使得右肾功能受损严重。如果双侧肾积水比较严重的话还可能导致尿毒症的发生。
血尿血尿是右肾结石最典型的症状之一，这是由于结石进入肾盂或输尿管，引起输尿管剧烈的蠕动，从而出现血尿。可以分为肉眼血尿与显微镜下血尿。
尿路梗阻通常可导致梗阻以上部位积水，如下输尿管结石可造成中、上输尿管及肾盂积水。结石的梗阻通常是不完全性梗阻，如果双侧输尿管或尿道梗阻则会出现尿闭，严重者可发展为尿毒症。
其它并发症当继发急性肾盂肾炎时病人可有发热、畏寒等全身症状;结石堵塞尿路时，则可引起肾积水;当双侧肾结石引起双侧完全性尿路梗阻时还可致无尿甚至是急慢性肾功能衰竭、尿毒症。