STR鉴定结果怎么看?
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发布时间：2025-01-08 10:03
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时间：2025-01-08 10:29
STR（Short Tandem Repeat，短串联重复序列）是一种基因位点，包含长度3-7个碱基对的短串连重复序列。这些序列在人类基因组中广泛存在，作为高度多态性标记，具有作为细胞DNA指纹的潜力。STR基因座的等位基因通过扩增区域重复序列的拷贝数来区分。PCR（聚合酶链式反应）用于检测这些基因座，通过毛细管电泳分离后使用荧光检测来识别。依据所得的STR分型结果，与专业细胞STR数据库对比，可以推算出样品所属的细胞系或潜在交叉污染的细胞系。
STR分型图谱显示PCR扩增后的片段长度和分型信息。通常情况下，人源或小鼠细胞的STR图谱上，一个基因位点会出现1个或2个峰，表示纯合或杂合状态。然而，出现3个或更多峰称为多等位基因。这种情况下，1-2个多等位基因可能源自细胞变异，不视为污染；≥3个多等位基因则可能提示存在同源物种交叉污染。
以MDA-MB-436和RKO细胞为例，它们的STR位点信息均显示良好，无人源细胞交叉污染。所有位点均为单（纯合）或双峰（杂合）。通过与细胞数据库的比对，可以获取更多相关信息，数据来源包括ATCC、DSMZ、JCRB等细胞库以及文献和资料记载。
STR鉴定结果与匹配度密切相关。匹配度≥80%表示细胞系为标准细胞系或衍生细胞系，55%-80%需要结合细胞系形态、特异性标记物等进行辅助分析和综合判断，≤55%则与标准细胞系无关。
对于无法采用STR鉴定检测的人及部分小鼠以外种属细胞，以及种属间细胞交叉污染问题，可以采用细胞种属鉴定方法。线粒体COI基因具有种属特异性，常用于物种鉴定。通过提取细胞DNA，用种属荧光复合引物MIX扩增动物线粒体COI基因，然后通过琼脂糖凝胶电泳分析，可以快速准确地判断细胞种属及是否存在不同种属交叉污染。不同的物种具有特定的碱基长度，例如智人391bp、中国仓鼠315bp、恒河猴287bp、非洲绿猴222bp、大鼠196bp、犬172bp、小鼠150bp、牛102bp等。
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时间：2025-01-08 10:35
STR（Short Tandem Repeat，短串联重复序列）是一种基因位点，包含长度3-7个碱基对的短串连重复序列。这些序列在人类基因组中广泛存在，作为高度多态性标记，具有作为细胞DNA指纹的潜力。STR基因座的等位基因通过扩增区域重复序列的拷贝数来区分。PCR（聚合酶链式反应）用于检测这些基因座，通过毛细管电泳分离后使用荧光检测来识别。依据所得的STR分型结果，与专业细胞STR数据库对比，可以推算出样品所属的细胞系或潜在交叉污染的细胞系。
STR分型图谱显示PCR扩增后的片段长度和分型信息。通常情况下，人源或小鼠细胞的STR图谱上，一个基因位点会出现1个或2个峰，表示纯合或杂合状态。然而，出现3个或更多峰称为多等位基因。这种情况下，1-2个多等位基因可能源自细胞变异，不视为污染；≥3个多等位基因则可能提示存在同源物种交叉污染。
以MDA-MB-436和RKO细胞为例，它们的STR位点信息均显示良好，无人源细胞交叉污染。所有位点均为单（纯合）或双峰（杂合）。通过与细胞数据库的比对，可以获取更多相关信息，数据来源包括ATCC、DSMZ、JCRB等细胞库以及文献和资料记载。
STR鉴定结果与匹配度密切相关。匹配度≥80%表示细胞系为标准细胞系或衍生细胞系，55%-80%需要结合细胞系形态、特异性标记物等进行辅助分析和综合判断，≤55%则与标准细胞系无关。
对于无法采用STR鉴定检测的人及部分小鼠以外种属细胞，以及种属间细胞交叉污染问题，可以采用细胞种属鉴定方法。线粒体COI基因具有种属特异性，常用于物种鉴定。通过提取细胞DNA，用种属荧光复合引物MIX扩增动物线粒体COI基因，然后通过琼脂糖凝胶电泳分析，可以快速准确地判断细胞种属及是否存在不同种属交叉污染。不同的物种具有特定的碱基长度，例如智人391bp、中国仓鼠315bp、恒河猴287bp、非洲绿猴222bp、大鼠196bp、犬172bp、小鼠150bp、牛102bp等。
